Аминокислоты – производные карбоновых кислот, в молекуле которых атом водорода у С, стоящего в альфа-положении, замещен аминогруппой. Общая формула L-изомеров аминокислот: Отличаются аминокислоты между собой функциональными группами в боковой цепи (R). Каждая аминокислота имеет тривиальное, рациональное и сокращенное трех- или однобуквенное обозначение, например, глицин, аминоуксусная, гли. Тривиальное название чаще всего связано с источником выделения или свойствами аминокислоты: серин входит в состав фиброина шелка (от лат. serius – шелко-вистый), тирозин впервые выделен из сыра (от греч. tyros – сыр), глутамин выделен из клейковины злаковых (от лат. gluten – клей), цистин – из камней мочевого пузыря (от греч. kystis – пузырь), аспарагиновая кислота – ростков спаржи (от лат. asparagus – спаржа), глицин от греч. glykos – сладкий. Рациональное название складывается исходя из того, что каждая аминокислота является производной соответствующей карбоновой кислоты. Сокращенное обозначение используют для написания аминокислотного состава и последовательности аминокислот в цепи. В биохимии чаще всего применяют тривиальное и сокращенное обозначение.
Классификация аминокислот. Существует несколько классификаций: 1) по химической природе боковой цепи (R), 2) рациональная классификация (по степени полярности радикала, по Ленинджеру), 3) по способности синтезироваться в организме.
По химической природе боковой цепи (R) все аминокислоты делятся на: 1. Ациклические (алифатические):
• моноаминомонокарбоновые (содержат 1 NH2- и 1 СООН-группы);
• моноаминодикарбоновые (содержат 1 NH2– и 2 СООН–группы);
• диаминомонокарбоновые (содержат 2 NH2– и 1 СООН–группы);
• диаминодикарбоновые (содержат 2 NH2– и 2 СООН–группы).
2. Циклические: a) гомоциклические (фен, тир);
б) гетероциклические:
• аминокислоты (гис, три);
• иминокислоты (про).
По Ленинджеру (по способности радикала взаимодействовать с водой) все аминокислоты делят на 4 группы:
• неполярные, незаряженные (гидрофобные) – их 8: ала, вал, лей, иле, мет, фен, три, про; • полярные, незаряженные (гидрофильные) – их 7: сер, тре, глн, асн, цис, тир, гли;
• отрицательно-заряженные – их 2: асп, глу; • положительно-заряженные – их 3: гис, арг, лиз.
По способности синтезироваться в организме аминокислоты могут быть:
• заменимыми, которые могут синтезироваться в организме;
• незаменимыми, которые не могут синтезироваться в организме и должны поступать с пищей.
Понятие «незаменимые» относительно для каждого вида – у человека и свиней их 10 (вал, лей, иле, тре, мет, фен, три, арг, гис, лиз), у животных с четырехкамерным желудком – 2 серосодержащие (цис, мет), у птиц – 1 (гли).